针对老板承认员工受伤但不承认是工伤的情况，员工在申请劳动仲裁时，除了提交包含劳动者和用人单位基本信息的仲裁申请书外，还需准备能证明工伤事实的相关证据。根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，员工应提供如医疗记录、事故现场照片、目击者证言等，以证明其受伤符合工伤认定条件。同时，可引用《工伤保险条例》第十四条、第十五条的具体规定，详细说明受伤情况符合工伤认定标准。
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若老板在仲裁过程中提出异议，员工应：1. 保持冷静，坚持自己的主张，并准备好反驳材料；2. 强调已提交的证据链完整性，如医疗证明、工伤认定申请书等；3. 如有必要，可申请专家证人出庭，对工伤认定提供专业意见；4. 遵循仲裁庭程序，积极配合调查，确保仲裁过程顺利进行。
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员工应：1. 详细了解《劳动争议调解仲裁法》及《工伤保险条例》的相关规定；2. 准备充分的证据材料，包括医疗记录、事故报告、目击者证言等；3. 按时提交仲裁申请，确保申请书内容准确无误；4. 在仲裁过程中，积极陈述事实，反驳对方异议；5. 如有必要，寻求专业法律援助，确保自身权益得到充分保护。