年终奖分两次发放通常合法，但需符合公司规定及劳动法。年终奖属于奖金范畴，发放方式由企业自主决定，但需明确告知员工并遵守相关法律法规。若员工对发放方式有异议且公司无法提供合理依据，可能构成违法。当发现公司随意更改发放规则或克扣奖金时，问题较为严重，应及时咨询律师。
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从法律角度，年终奖分两次发放的具体操作如下：1. 若公司规章制度或劳动合同中已明确规定年终奖分两次发放，员工应遵守此规定，公司按约定时间足额发放即可。2. 若无明确规定，公司应与员工协商达成一致意见，并签订书面协议明确发放时间及金额，以确保双方权益。3. 若员工对年终奖发放方式有异议，可通过与公司沟通、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自身权益。在处理过程中，员工应保留好相关证据，如工资条、劳动合同等，以便证明自身主张。同时，公司也应积极应对员工诉求，避免引发更大纠纷。
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从法律角度看，年终奖分两次发放的处理方式需遵循公司规章制度及劳动合同约定。若公司规定或合同中有明确条款，员工应遵守；若无明确规定，公司应与员工协商达成一致。选择处理方式时，应优先考虑公司规定及合同约定，若存在争议，可通过协商、调解或法律途径解决。